海事海商纠纷实行专门管辖：一审案件由海事法院受理，上诉案件由海事法院所在地的高级人民法院审理，再审申请向最高人民法院提出。处理流程通常为"诉前海事请求保全／证据保全／海事强制令—起诉立案—审理（含船舶优先权催告、海事赔偿责任限制基金等特别程序）—裁判—上诉与执行"。期限上必须特别注意《海商法》规定的短期诉讼时效：海上货物运输索赔、海上拖航合同、共同海损分摊为1年，船舶碰撞、海难救助、海上保险赔偿、船舶租用合同为2年，船舶油污损害为3年。时效一旦届满，实体权利将难以通过诉讼实现。
一、管辖法院：海事法院专门管辖，上诉到所在地高院
《中华人民共和国海事诉讼特别程序法》第四条规定，海事法院受理当事人因海事侵权纠纷、海商合同纠纷以及法律规定的其他海事纠纷提起的诉讼。最高人民法院《关于海事法院受理案件范围的规定》（法释〔2016〕4号）进一步列明了海事法院受理的案件类型，并明确地方人民法院以及海事法院之外的其他专门人民法院不得受理上述案件。这意味着，船舶碰撞、海上货物运输合同、船舶买卖与建造、船员劳务、海上保险、船舶油污损害等纠纷，应当向海事法院起诉，当事人约定由普通地方法院管辖的协议通常不发生效力（存在有效仲裁条款的除外）。
目前全国设有大连、天津、青岛、上海、南京、宁波、厦门、武汉、广州、北海、海口等海事法院。海事法院在审级上相当于中级人民法院，对其一审判决、裁定不服的，向该海事法院所在地的高级人民法院提起上诉。地域管辖一般依照《民事诉讼法》确定，但《海事诉讼特别程序法》第七条对三类案件作了特别规定：沿海港口作业纠纷由港口所在地海事法院管辖；海域污染损害纠纷由污染发生地、损害结果地或采取预防污染措施地海事法院管辖；在我国领域及有管辖权海域履行的海洋勘探开发合同纠纷由合同履行地海事法院管辖。
二、处理流程：从诉前保全到裁判执行
海事案件最具特色的是诉前与诉中的特别程序，实务中往往决定案件成败。
- 海事请求保全：依《海事诉讼特别程序法》第十三条，起诉前申请扣押船舶、船载货物或船用燃油的，应向被保全财产所在地海事法院提出。法院接受申请后应在四十八小时内作出裁定，裁定保全的立即执行。
- 海事证据保全：该法第二十一条规定，起诉前申请海事证据保全的，向被保全证据所在地海事法院提出，适用于航海日志、轮机日志、装卸记录等易灭失证据。
- 海事强制令：该法第五十一条规定，当事人申请海事强制令的，向海事纠纷发生地海事法院提出，法院受理后应在四十八小时内作出裁定。常见于要求承运人交付货物、签发或交付提单等情形。
- 审理中的特别程序：